Pada Januari 2006, Pasukan Bantuan Keamanan Internasional (ISAF) dikerahkan ke Afghanistan untuk membantu militer AS dan Inggris dalam memerangi paramiliter Islam Taliban. Pemerintah AS menuduh Taliban menyembunyikan kepala al-Qaeda, Osama bin Laden, dan menuntut ekstradisinya. Pimpinan Taliban menolak untuk memenuhi permintaan ini, dengan mengatakan bahwa Amerika Serikat tidak memberikan bukti kesalahan Osama dalam serangan 11/9/2001.
Pada akhir tahun 2001, struktur militer Taliban praktis hancur, dan perlawanan para pendukungnya berbentuk gerakan gerilya. Negara-negara Barat telah banyak berinvestasi dalam pengembangan demokrasi dan struktur sosial Afghanistan. Pada tahun 2004, pemilihan presiden pertama negara itu dimenangkan oleh Hamid Karzai, seorang politisi yang cukup setia kepada Barat. Namun, perlawanan pendukung Taliban gagal diredam. Para gerilyawan bertempur dengan sengit meskipun ISAF memiliki keunggulan militer yang luar biasa.
Prancis, seperti anggota aliansi lainnya, menderita kerugian dalam peralatan dan tenaga kerja. Selama 10 tahun perang di Afghanistan, 83 tentara tewas dan beberapa kali lagi terluka. Keputusan untuk melibatkan Prancis dalam operasi militer tidak terlalu populer di kalangan penduduk, dan laporan tentang korban di antara tentara Prancis meningkatkan ketidakpuasan terhadap pemerintah.
Pada 20 Januari 2012, di provinsi Kapisa, seorang pria berseragam tentara Afghanistan menembak 4 orang dan melukai 16 tentara Prancis. Setelah itu, Nicolas Sarkozy (Presiden Prancis 2007-2012) mengatakan bahwa karena pemerintah Afghanistan tidak dapat menjamin keselamatan pasukan Prancis, Prancis menangguhkan kehadiran militernya di negara itu. Sarkozy berjanji untuk menarik pasukan dari Afghanistan pada awal 2014.
Pada 2012, François Hollande terpilih sebagai Presiden Prancis, yang mengumumkan rencana baru untuk mundur dari Afghanistan. 2.000 prajurit akan ditarik pada akhir 2012, 1.400 tetap sebagai instruktur dan untuk menjaga fasilitas sosial. Presiden menjelaskan keputusannya dengan fakta bahwa bahaya dari teroris telah berkurang, demokrasi tumbuh lebih kuat, dan negara harus berkembang secara mandiri. Kepala republik berjanji bahwa Prancis akan terus mendukung Afghanistan, tetapi dalam bentuk yang berbeda.
